Вихідний код Waterfox є спеціалізованою модифікацією платформи Mozilla, розробленою з урахуванням конфіденційності та вибору користувача. Ви зможете встановити його та скомпілювати Waterfox без проблем. Також було впроваджено інші модифікації та виправлення, які є вищими, щоб виправити будь-які проблеми сумісності/безпеки, які Mozilla може відставати у впровадженні (зазвичай через невисокий пріоритет). Функції з високим запитом, видалені Mozilla, але потрібні користувачам, зберігаються (якщо їх не видалено через міркування безпеки). Waterfox зосереджується на тому, щоб надати користувачам вибір. Браузер орієнтований на досвідчених користувачів, що дозволяє приймати важливі рішення. Немає білого списку плагінів (це означає, що ви можете запускати Java-аплети та програми Silverlight), ви можете запускати будь-які розширення, які забажаєте (включаючи завантажувальні додатки, які можуть повністю змінити функціональність браузера), і жодні дані чи телеметрія не надсилаються назад до Mozilla чи проекту Waterfox. Переглядайте веб-сторінки по-своєму за допомогою інді-браузера: відсутність телеметрії, обмежене збирання даних, плагіни NPAPI, додатки для початкового завантаження, вдосконалення вашого користувацького Chrome, стабільний API.