EncFS, Ücretsiz (LGPL) FUSE tabanlı bir şifreleme dosya sistemidir. Şifrelenmiş dosyalar için depolama alanı olarak rastgele bir dizin kullanarak dosyaları şeffaf bir şekilde şifreler. Bir EncFS dosya sisteminin montajında ​​iki dizin bulunur: kaynak dizin ve bağlama noktası. Bağlantı noktasındaki her dosyanın kaynak dizininde kendisine karşılık gelen belirli bir dosyası vardır. Bağlantı noktasındaki dosya, kaynak dizindeki dosyanın şifrelenmemiş görünümünü sağlar. Dosya adları kaynak dizinde şifrelenir. Dosyalar, şifrelenmiş kaynak dizinin içinde veya dışında saklanan bir ses düzeyi anahtarı kullanılarak şifrelenir. Bu anahtarın şifresini çözmek için bir şifre kullanılır.