EncFS เป็นระบบไฟล์เข้ารหัสที่ใช้ FUSE ฟรี (LGPL) มันเข้ารหัสไฟล์อย่างโปร่งใส โดยใช้ไดเร็กทอรีที่กำหนดเองเป็นที่เก็บข้อมูลสำหรับไฟล์ที่เข้ารหัส สองไดเร็กทอรีเกี่ยวข้องกับการติดตั้งระบบไฟล์ EncFS: ไดเร็กทอรีต้นทางและจุดเมานท์ แต่ละไฟล์ในจุดเมานท์มีไฟล์เฉพาะในไดเร็กทอรีต้นทางที่สอดคล้องกับไฟล์นั้น ไฟล์ในจุดเมานท์จัดเตรียมมุมมองที่ไม่ได้เข้ารหัสของไฟล์ในไดเร็กทอรีต้นทาง ชื่อไฟล์ถูกเข้ารหัสในไดเร็กทอรีต้นทาง ไฟล์จะถูกเข้ารหัสโดยใช้ปุ่มปรับระดับเสียง ซึ่งจัดเก็บไว้ภายในหรือภายนอกไดเร็กทอรีต้นทางที่เข้ารหัส รหัสผ่านใช้เพื่อถอดรหัสคีย์นี้