EncFS je brezplačen (LGPL) kriptografski datotečni sistem, ki temelji na FUSE. Transparentno šifrira datoteke in uporablja poljuben imenik kot shrambo za šifrirane datoteke. Pri nameščanju datotečnega sistema EncFS sta vključena dva imenika: izvorni imenik in točka priklopa. Vsaka datoteka v točki priklopa ima določeno datoteko v izvornem imeniku, ki ji ustreza. Datoteka v točki priklopa nudi nešifriran pogled datoteke v izvornem imeniku. Imena datotek so šifrirana v izvornem imeniku. Datoteke so šifrirane z uporabo glasnostnega ključa, ki je shranjen znotraj ali zunaj šifriranega izvornega imenika. Za dešifriranje tega ključa se uporablja geslo.