O código-fonte do Waterfox é uma modificação especializada da plataforma Mozilla, projetada tendo em mente a privacidade e a escolha do usuário. Você deve conseguir instalá-lo e compilar o Waterfox sem problemas. Outras modificações e patches mais avançados também foram implementados para corrigir quaisquer problemas de compatibilidade/segurança que a Mozilla possa atrasar na implementação (geralmente devido a não ser de alta prioridade). Recursos de alta solicitação removidos pela Mozilla, mas desejados pelos usuários, são mantidos (se não forem removidos por questões de segurança). Waterfox se concentra em dar escolha aos usuários. O navegador é focado em usuários avançados, o que permite que você tome decisões importantes. Não há lista de permissões de plug-ins (o que significa que você pode executar miniaplicativos Java e aplicativos Silverlight), você pode executar quaisquer extensões que desejar (incluindo complementos inicializados que podem alterar completamente a funcionalidade do navegador) e absolutamente nenhum dado ou telemetria é enviado de volta ao Mozilla ou ao projeto Waterfox. Navegue na web do seu jeito, com o navegador independente: sem telemetria, coleta de dados limitada, plug-ins NPAPI, complementos inicializados, aprimore seu userChrome, API estável.