EncFS to darmowy (LGPL) kryptograficzny system plików oparty na FUSE. W przejrzysty sposób szyfruje pliki, wykorzystując dowolny katalog jako miejsce przechowywania zaszyfrowanych plików. Do montowania systemu plików EncFS zaangażowane są dwa katalogi: katalog źródłowy i punkt montowania. Każdemu plikowi w punkcie montowania odpowiada określony plik w katalogu źródłowym. Plik w punkcie montowania zapewnia niezaszyfrowany widok pliku w katalogu źródłowym. Nazwy plików są szyfrowane w katalogu źródłowym. Pliki są szyfrowane przy użyciu klucza woluminu, który jest przechowywany w zaszyfrowanym katalogu źródłowym lub poza nim. Do odszyfrowania tego klucza używane jest hasło.