EncFS एक निःशुल्क (LGPL) FUSE-आधारित क्रिप्टोग्राफ़िक फ़ाइल सिस्टम है। यह एन्क्रिप्टेड फ़ाइलों के भंडारण के रूप में एक मनमाना निर्देशिका का उपयोग करके फ़ाइलों को पारदर्शी रूप से एन्क्रिप्ट करता है। EncFS फ़ाइल सिस्टम को माउंट करने में दो निर्देशिकाएँ शामिल होती हैं: स्रोत निर्देशिका, और माउंटपॉइंट। माउंटपॉइंट की प्रत्येक फ़ाइल में स्रोत निर्देशिका में एक विशिष्ट फ़ाइल होती है जो उससे मेल खाती है। माउंटपॉइंट में फ़ाइल स्रोत निर्देशिका में से एक का अनएन्क्रिप्टेड दृश्य प्रदान करती है। फ़ाइल नाम स्रोत निर्देशिका में एन्क्रिप्ट किए गए हैं। फ़ाइलों को वॉल्यूम कुंजी का उपयोग करके एन्क्रिप्ट किया जाता है, जिसे एन्क्रिप्टेड स्रोत निर्देशिका के भीतर या बाहर संग्रहीत किया जाता है। इस कुंजी को डिक्रिप्ट करने के लिए एक पासवर्ड का उपयोग किया जाता है।