O código fonte Waterfox é unha modificación especializada da plataforma Mozilla, deseñada para a privacidade e a elección do usuario. Deberías poder instalalo e compilar Waterfox sen problemas. Tamén se implementaron outras modificacións e parches que están máis arriba para solucionar calquera problema de compatibilidade/seguridade que Mozilla poida quedar atrasado na implementación (normalmente porque non é de alta prioridade). As funcións de alta solicitude eliminadas por Mozilla pero desexadas polos usuarios mantéñense (se non se eliminan por motivos de seguridade). Waterfox céntrase en darlle opcións aos usuarios. O navegador está enfocado aos usuarios avanzados, o que che permite tomar as decisións importantes. Non hai unha lista branca de complementos (o que significa que pode executar Applets Java e aplicacións Silverlight), pode executar as extensións que queira (incluíndo complementos de arranque que poden cambiar completamente a funcionalidade do navegador) e non se envían datos nin telemetría a Mozilla nin ao proxecto Waterfox. Navega pola web ao teu xeito, co navegador web independente: sen telemetría, recollida de datos limitada, complementos NPAPI, complementos con arranque, polaco o teu usuario Chrome, API estable.