EncFS est un système de fichiers cryptographique gratuit (LGPL) basé sur FUSE. Il crypte les fichiers de manière transparente, en utilisant un répertoire arbitraire comme stockage pour les fichiers cryptés. Deux répertoires sont impliqués dans le montage d'un système de fichiers EncFS : le répertoire source et le point de montage. Chaque fichier du point de montage possède un fichier spécifique dans le répertoire source qui lui correspond. Le fichier du point de montage fournit la vue non chiffrée de celui du répertoire source. Les noms de fichiers sont chiffrés dans le répertoire source. Les fichiers sont chiffrés à l'aide d'une clé de volume, qui est stockée dans ou en dehors du répertoire source chiffré. Un mot de passe est utilisé pour déchiffrer cette clé.