EncFS یک سیستم فایل رمزنگاری مبتنی بر FUSE رایگان (LGPL) است. به طور شفاف فایل ها را رمزگذاری می کند و از یک دایرکتوری دلخواه به عنوان ذخیره برای فایل های رمزگذاری شده استفاده می کند. دو دایرکتوری در نصب یک فایل سیستم EncFS دخیل هستند: دایرکتوری منبع و نقطه مونت. هر فایل در mountpoint یک فایل خاص در دایرکتوری منبع دارد که با آن مطابقت دارد. فایل موجود در mountpoint نمای رمزگذاری نشده ای را در فهرست منبع ارائه می دهد. نام فایل ها در دایرکتوری منبع رمزگذاری می شوند. فایل ها با استفاده از یک کلید حجم، که در داخل یا خارج از فهرست منبع رمزگذاری شده ذخیره می شود، رمزگذاری می شوند. برای رمزگشایی این کلید از رمز عبور استفاده می شود.