EncFS es un sistema de archivos criptográfico gratuito (LGPL) basado en FUSE. Cifra archivos de forma transparente, utilizando un directorio arbitrario como almacenamiento para los archivos cifrados. En el montaje de un sistema de archivos EncFS intervienen dos directorios: el directorio de origen y el punto de montaje. Cada archivo en el punto de montaje tiene un archivo específico en el directorio de origen que le corresponde. El archivo en el punto de montaje proporciona la vista sin cifrar del que está en el directorio de origen. Los nombres de archivos están cifrados en el directorio de origen. Los archivos se cifran mediante una clave de volumen, que se almacena dentro o fuera del directorio de origen cifrado. Se utiliza una contraseña para descifrar esta clave.