Waterfox-kildekoden er en specialiseret modifikation af Mozilla-platformen, designet til privatliv og brugervalg i tankerne. Du burde være i stand til at installere det og kompilere Waterfox uden problemer. Andre modifikationer og patches, der er mere opstrøms, er også blevet implementeret for at løse eventuelle kompatibilitets-/sikkerhedsproblemer, som Mozilla kan sakke bagud i implementeringen (normalt på grund af ikke at have høj prioritet). Funktioner med høj anmodning, som er fjernet af Mozilla, men som brugere ønsker, bibeholdes (hvis de ikke fjernes på grund af sikkerheden). Waterfox fokuserer på at give brugerne valgmuligheder. Browseren er fokuseret på superbrugere, hvilket lader dig træffe de vigtige beslutninger. Der er ingen plugin-hvidliste (hvilket betyder, at du kan køre Java-applets og Silverlight-apps), du kan køre hvilke udvidelser du vil (inklusive bootstrappede tilføjelser, der fuldstændigt kan ændre browserens funktionalitet), og absolut ingen data eller telemetri sendes tilbage til Mozilla eller Waterfox-projektet. Surf på nettet på din måde med indie-webbrowseren: Ingen telemetri, begrænset dataindsamling, NPAPI-plugins, bootstrapped-tilføjelser, polsk din brugerChrome, stabil API.