Zdrojový kód Waterfox je specializovaná modifikace platformy Mozilla navržená s ohledem na soukromí a volbu uživatele. Měli byste být schopni nainstalovat a zkompilovat Waterfox bez problémů. Byly také implementovány další úpravy a záplaty, které jsou více upstream, aby opravily jakékoli problémy s kompatibilitou/bezpečností, u kterých může Mozilla zaostávat v implementaci (obvykle kvůli tomu, že nemají vysokou prioritu). Funkce s vysokými požadavky, které Mozilla odstranila, ale uživatelé je chtěli, jsou zachovány (pokud nejsou odstraněny z důvodu zabezpečení). Waterfox se zaměřuje na to, aby uživatelé měli možnost volby. Prohlížeč je zaměřen na pokročilé uživatele, což vám umožňuje dělat důležitá rozhodnutí. Neexistuje žádný seznam povolených pluginů (to znamená, že můžete spouštět aplikace Java Applets a Silverlight), můžete spouštět libovolná rozšíření (včetně bootstrapped doplňků, které mohou zcela změnit funkčnost prohlížeče) a do Mozilly nebo projektu Waterfox se neposílají žádná data ani telemetrie. Procházejte web po svém s nezávislým webovým prohlížečem: Žádná telemetrie, Omezený sběr dat, Pluginy NPAPI, Bootstrapped Add-ons, Polish your userChrome, Stable API.