EncFS és un sistema de fitxers criptogràfic gratuït (LGPL) basat en FUSE. Xifra els fitxers de manera transparent, utilitzant un directori arbitrari com a emmagatzematge dels fitxers xifrats. En muntar un sistema de fitxers EncFS participen dos directoris: el directori font i el punt de muntatge. Cada fitxer del punt de muntatge té un fitxer específic al directori font que li correspon. El fitxer del punt de muntatge proporciona la vista sense xifrar del del directori font. Els noms de fitxers estan xifrats al directori font. Els fitxers es xifren mitjançant una clau de volum, que s'emmagatzema dins o fora del directori font xifrat. S'utilitza una contrasenya per desxifrar aquesta clau.